Na Academia Kadic, Aelita é visitada por seu pai e advertiu sobre um ataque. No dia seguinte, monstros de X.A.N.A. invadiram a área, atacando a todos e a todos. Agora, os Guerreiros Lyoko são atacados por um novo inimigo que tem a capacidade de assumir o controle dos guerreiros. Esteja com esses guerreiros para ajudá-los!